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Le maximum de vraisemblance

Je continue ma lancée avec ce billet traitant d'un sujet important aussi bien en statistique qu'en intelligence artificielle: Le maximum de vraisemblance. Je rappelle que je ne suis ni statisticien ni mathématicien et que j'essaie d'expliquer ces concepts avec un simple regard naïf de programmeur. (C ...

La distribution de χ2

Si vous avez touché un tant soit peu les statistiques, vous connaissez certainement le test de χ². Et comme moi, vous avez certainement du jongler avec des formules ou des notions comme le "degré de liberté" sans vraiment comprendre d'où ça venait. Ce soir, par un élan de motivation ...

Convertir HPO en base de données Sqlite

Pour mon projet cutevariant, j'ai été amené à devoir convertir l'ontologie HPO (disponible au format obo) en base de données SQLite. Pour ceux qui ne connaissent pas, HPO (Human Phenotype Ontology) est une ontologie décrivant des signes cliniques. C'est-à-dire un vocabulaire standardisé et hiérarchisé afin d'aider ...

Les TADs et l'organisation spatiale du génome

Lors de la mitose, l'ADN des cellules eucaryotes s'organise en chromosomes condensés et bien délimités. C'est l'image que nous avons tous d'un chromosome. Mais le reste du temps, pendant l'interphase, ces chromosomes ressemblent davantage à une boule de spaghetti emmêlée dans tous les sens ...

ADN et jeu du chaos

Vous connaissez le jeu du chaos? Il s'agit d'une construction géométrique très simple permettant de faire apparaitre des fractales. La construction la plus connue est le triangle de Sierpinski que vous pouvez dessiner vous-même avec un papier et un crayon:

  • Dessiner un triangle en numérotant les trois sommets ...

Les algorithmes avec la STL

J'utilise de plus en plus dans mon code C++, les algorithmes de la librairie standard. Couplés avec les lambdas expression, j'évite d'écrire des tas de boucles for, et mon code est plus lisible. Sans oublier que cette programmation générique est compatible avec les containers Qt. Donc forcément ...

Changer l'humanité avec le « gene drive »

C'est le 2 août 1939 qu'Albert Einstein publie une lettre au Président Roosevelt pour le prévenir du risque de voir apparaître une bombe atomique après la découverte de la réaction en chaîne. Six ans plus tard, quasiment jour pour jour, la bombe atomique tombe sur Hiroshima. Pourquoi je ...

La sélection génomique de la semaine #5

Voici ma sélection de l'actualité en génétique/génomique de la semaine du 18/09/2017.

La sélection génomique de la semaine #4

Voici ma sélection de l'actualité en génétique/génomique de la semaine du 11/09/2017.

La sélection génomique de la semaine #3

Voici ma sélection de l'actualité en génétique/génomique de la semaine du 04/09/2017.