bioinformatique génétique médecine
Cela vous est forcément déjà arrivé de devoir renommer une longue liste de fichiers. Pour les plus fainéant d'entre vous, vous allez cliquer sur un fichier, un par un , puis faire "F2" pour renommer. Bon, ça passe, avec 10 fichiers, mais pour certaine personne, renommer plus de 3 fichiers de …
Dans ce post, nous allons voir comment naviguer dans le génome humain. Celui ci a été entièrement séquencé grâce à un consortium international de chercheurs au sein du Human Genom Project entre 1990 et 2003. Ce génome fait environ 3 milliards de bases, soit un fichier texte d'environ 3 GigaOctets …
Il y a quelques temps de cela, un collègue anatomo-pathologiste était venu demander mon aide pour détecter des cellules sur des images histologiques d'amygdales. Ces images étaient issues d'un scanner à lame microscopique et stockées sous un format propriétaire Hamamatsu (.ndpi).
Bref, c'était mes débuts dans l'analyse et le traitement …
Les expressions régulières, c'est super simple... Il suffit que quelqu'un les écrivent pour vous !
En effet, j'ai longtemps galéré avec les expressions régulières.. En fait, dès que j'avais affaire à elles, je demandais à quelqu'un de me l'écrire. C’était beaucoup plus rapide que de réfléchir par moi même! ( technique …
Il existe plusieurs façons de créer de jolis graphiques avec python. La plus connue est bien entendu matplotlib qui permet de faire du simple camembert au super graphique 3D isobarique spéctromotogramique. (je vous rassure ça veux rien dire). Il y en a aussi d'autres, moins connus que je cite en …
MongoDB est un système de gestion de base de données ou SGBD, comme Mysql ou PostgreSql, mais dont le mécanisme est complètement différent. Fini le temps ou il fallait créer un schéma de tables relationnelles et créer des requêtes Sql complexes. Grâce à MongoDB vous allez pouvoir stocker vos données …
Requests est un module python permettant d'utiliser le protocole http de façon ultra simple! Je l'ai découvert en voulant récupérer des données d'une page web au boulot à travers un proxy. Car en effet, il gère vraiment tout ! Les proxy, les cookies, ssl, les uploads multiparts et bien d'autres trucs …
L'Open Data, comme son nom l'indique, est un ensemble de données ouvertes sous licence libre , fournit par des organismes publiques ou privés. En d'autres mots, vous allez pouvoir utiliser gratuitement un tas de données, directement ou via une api, pour faire de la Recherche, des études statistiques et surtout …
Hello, à tous ! Bon, j'ai enfin passé le cap de la création de blog. A vrai dire, j'avais déjà essayé auparavent d'autres systèmes de blog comme wordpress ou blogger. Mais j'ai pas tenu longtemps car je perdais vraiment tout mon temps à écrire du html et à checker le rendu …