bioinformatique génétique médecine
Cela fait un bon moment que j'entends parler des fichiers Parquet. Un format binaire beaucoup plus léger
que les fichiers CSV pour le stockage des tableaux de données.
Lorsque j'ai vu pour la première fois un collègue faire une requête SQL quasi instantanée sur des millions des lignes répartis sur …
Python n'étant pas connu pour sa rapidité, il existe plusieurs solutions pour exécuter du code compilé. Je citerai par exemple numba qui utilise des décorateurs dédiés ou encore cython qui permet d'écrire un module avec un langage mélangeant du python et du C.
Mais mon regard s'est porté récemment vers …
Un DSL ( Domain Specific Language ) est un langage de programmation créé pour une tâche spécifique à l'inverse des langages de programmation usuels comme Python. On peut s'en servir par exemple pour créer des petits langages maison utilisés au sein d'une application.
Dans ce billet, je vais vous montrer en Python …
L'analyse en composante principale ou PCA (Principal component analysis) est une méthode de réduction de dimension, largement utilisée en statistique descriptive, pour visualiser sur un graphique à 2 ou 3 dimensions des données décrites sur plus de dimensions. Dans ce billet, nous chercherons d'abord à comprendre le principe général avec …
On dit souvent qu'être fainéant est gage de qualité chez un programmeur. Dans le sens où il cherchera à résoudre un problème en tapant un minimum de ligne de code et en déléguant au maximum à sa machine. C'est encore plus vrai avec la programmation par contrainte. Contrairement à la …
Cela fait un moment que j'avais envie de publier sur l'inférence bayésienne. Mon intérêt pour ce sujet a été éveillé par la lecture du livre La formule du savoir par Nguyên Hoang Lê. En deux mots, l'inférence bayésienne est une méthode qui permet de donner une crédibilité à nos …
Je continue ma lancée avec ce billet traitant d'un sujet important aussi bien en statistique qu'en intelligence artificielle: Le maximum de vraisemblance. Je rappelle que je ne suis ni statisticien ni mathématicien et que j'essaie d'expliquer ces concepts avec un simple regard naïf de programmeur. (C'est à dire sans formule …
Si vous avez touché un tant soit peu les statistiques, vous connaissez certainement le test de χ². Et comme moi, vous avez certainement du jongler avec des formules ou des notions comme le "degré de liberté" sans vraiment comprendre d'où ça venait. Ce soir, par un élan de motivation sans …
Un filtre de bloom est une structure de donnée permettant de savoir si un élément est présent ou non dans une liste. Cette structure est très efficace d'un point de vue mémoire lorsque vous travaillez sur de grande liste. En python, l'utilisation d'un filtre de Bloom peut s'écrire :
L = ["mario …Au temps ou le téléphone portable était un objet de luxe et de démesure, la seule façon d'envoyer un message pendant un cours de philosophie, était d'utiliser un petit bout de papier que l'on faisait passer d'élève à élève. Il fallait écrire en petit pour maximiser la quantité d'information transmis …